La galaxie est en danger. Une menace extraterrestre, un robot en remorque, veut s'emparer de la technologie qui sert à sauvegarder l'équilibre et la paix interstellaires. Divisée en 3 planètes, Fungal, Pluvius, Darkon, cette technologie est protégée à l'intérieur des conteneurs Commodore. Omega, notre héros, combattra les ennemis de l'humanité. Défenseur galactique hors pair, il a à ses côtés le Commodore qui le soutiendra et l'aidera dans ses combats. Ses armes sont le blaster armé de balles à énergie quantique et le Commodore Engine, un système d'amélioration de combinaison spatiale miraculeux qui, grâce à l'énergie des cristaux galactiques, lui donnera le pouvoir nécessaire pour se transformer d'Omega en Astro, et d'Astro en Ultra, devenant ainsi de plus en plus fort. Son apparence subira des changements, mais son cœur intrépide battra toujours pour le bien de la galaxie. Le jeu se déroule sur 15 niveaux, cinq pour chaque planète. Omega affrontera continuellement des robots ennemis en s'engageant dans une bataille massive contre trois Boss très puissants, dont la défaite dépendra de l'avancement de sa mission et de l'avenir de toutes les planètes menacées par l'invasion extraterrestre imminente.